יעקב בוז'יקובסקי גדל בהפועל פ"ת ושיחק בקבוצות הילדים השונות של המועדון החל מגיל 8. הוא עלה לקבוצה הבוגרת בעונת 1970/71, כשהוא בן 17.5, ובעונה זו שותף בעיקר כמחליף ע"י המאמן היוגוסלבי מילובאן באלין. גם בשנתיים שלאחר מכן לא הרבה לשחק, אך בסיום עונת 1973/74 כבר לקח חלק במשחק הגמר מול הפועל חיפה, אותו הפסידה הקבוצה משער שהובקע שלוש דקות לסיום ההארכה, ובעונת 1974/75 כבר שיחק לעתים קרובות יותר.
בוז'יקובסקי, שהחל לשחק כקיצוני שמאלי ובשלב מאוחר יותר עבר לקישור, הבקיע את שער הבכורה שלו בדרבי ששוחק בסיום העונה הנ"ל, ובעונה הבאה הבקיע שני שערים - אחד מהם שער ניצחון במשחק התחתית הקריטי מול הכח ר"ג, מחזור לסיום העונה, שהיה חייב להספיק בשביל להישאר בליגה, אבל במחזור האחרון הפסידה הקבוצה בכפ"ס וירדה לליגה השנייה לראשונה בתולדותיה.
בעונה שלאחר מכן כבר שיחק באופן קבוע והבקיע שלושה שערים, ובעונה הבאה הוסיף עוד שבעה, אבל בשתי העונות הפועל כשלה ולא הצליחה לעלות לליגה הראשונה. ב-1978/79 כבש חמישה שערים, כולל צמד תוך שמונה דקות לרשת הפועל חולון, והפעם שערים אלו סייעו במשימה והעלייה הושגה סוף סוף.
בוז'יקובסקי המשיך עם הקבוצה לעונה נוספת בליגה הראשונה, וב-1980/81 עבר למכבי הרצליה ולאחר מכן עבר ניתוח והושבת במשך שנה וחצי עקב פציעה בגיד אכילס. כשהחלים שיחק עוד עונה וחצי בהפועל מחנה-יהודה, ואז פרש מכדורגל.
עוד כששיחק במדי הקבוצה סיים לימודי תואר בהנדסת אלקטרוניקה, וב-1979 החל לעבוד כמורה לאלקטרוניקה בתיכון עמל ב' בפתח-תקוה.
