אלון כהן גדל במחלקת הנוער של מכבי יבנה ושיחק בנבחרת הנוער ובנבחרת האולימפית של ישראל. הוא הושאל להפועל פתח תקוה ממכבי יבנה באמצע עונת 1996/97, בגיל 23, כשלפני כן שיחק ביבנה ובעירוני אשדוד. הוא פתח בהרכב בעשרה משחקים עד לסיום העונה, וסיים עם הקבוצה במקום השני.
הוא המשיך גם בעונת 1997/98, וסבל מפציעה בחלק הראשון של העונה, אך גם כך רשם 21 הופעות בכל המסגרות (כולל צמד המשחקים בגביע אופ"א מול פלורה טאלין). אחרי סיום העונה שוחרר מהקבוצה. בהמשך שיחק בהפועל כפר סבא ובמכבי קרית גת.
הפועל פ"ת מודל 1996/97. שורה עליונה, מימין: לא מזוהה, דניאל אבס, בני קוזושווילי, וואליד באדיר, אבי פלטשר, אלון כהן, אנדריי כרישטופיק. שורה אמצעית: יואב הרשקו, יניב חרמש, יניב נחום, שי הס, אילן בוארון, אלון מאיה, מנור חסן. יושבים: יניב עופרי, אלון המרדינגר, ניר ארביב, מוטי קקון, אלי אברבנל, שלומי בן-חמו.
הפועל פ"ת מודל 1996/97. שורה עליונה, מימין: לא מזוהה, דניאל אבס, בני קוזושווילי, וואליד באדיר, אבי פלטשר, אלון כהן, אנדריי כרישטופיק. שורה אמצעית: יואב הרשקו, יניב חרמש, יניב נחום, שי הס, אילן בוארון, אלון מאיה, מנור חסן. יושבים: יניב עופרי, אלון המרדינגר, ניר ארביב, מוטי קקון, אלי אברבנל, שלומי בן-חמו.
1996/97 - מחזור 25 - בני יהודה (1:3) שחקני הפועל פ"ת חוגגים ניצחון בשכונת התקווה. מימין: אלי אברבנל, אלון כהן, מנור חסן, גאבור מרטון, מוטי קקון, אבי פלטשר, יניב עופרי ואילן בוארון
1996/97 - מחזור 25 - בני יהודה (1:3) שחקני הפועל פ"ת חוגגים ניצחון בשכונת התקווה. מימין: אלי אברבנל, אלון כהן, מנור חסן, גאבור מרטון, מוטי קקון, אבי פלטשר, יניב עופרי ואילן בוארון
הפועל פ"ת מודל 1997/98, תמונה קבוצתית. למעלה מימין: גאבור מרטון, אנדריי כרישטופיק, ליאור לרידו, וואליד באדיר, אבי פלטשר, עוזי אזולאי, מנור חסן, יניב חרמש, רני גולדינג (מאמן כושר). באמצע: יוסי רוזנצווייג, ניר לוין (מנג'ר), אלי מחפוד (מאמן), שלומי בן חמו, בני קוזושווילי, ליאור שחר (יו"ר), אלי אברבנל, אלון כהן, אלון מאיה, אילן בוארון, ישראל עיני (מאמן שוערים). למטה: דניאל אבס, דור גרשוביץ', יניב עופרי, אייל אברמוב, שי הס, גיא שמיר, מרקו אליוז.
הפועל פ"ת מודל 1997/98, תמונה קבוצתית. למעלה מימין: גאבור מרטון, אנדריי כרישטופיק, ליאור לרידו, וואליד באדיר, אבי פלטשר, עוזי אזולאי, מנור חסן, יניב חרמש, רני גולדינג (מאמן כושר). באמצע: יוסי רוזנצווייג, ניר לוין (מנג'ר), אלי מחפוד (מאמן), שלומי בן חמו, בני קוזושווילי, ליאור שחר (יו"ר), אלי אברבנל, אלון כהן, אלון מאיה, אילן בוארון, ישראל עיני (מאמן שוערים). למטה: דניאל אבס, דור גרשוביץ', יניב עופרי, אייל אברמוב, שי הס, גיא שמיר, מרקו אליוז.
1997/98 - מחזור 15 - הפועל ירושלים (0:1)
1997/98 - מחזור 15 - הפועל ירושלים (0:1)
