רפי כהן גדל בשכונת אוהל משה בירושלים, ובגיל 11 התחיל לשחק כדורגל לראשונה, בבית"ר י-ם, שם בילה עד גיל 16. בגיל זה קנה את כרטיס השחקן שלו מהקבוצה ועבר הישר למדי הקבוצה הבוגרת של היריבה העירונית, הפועל י-ם. הוא שיחק שם שנה אחת, חזר לבית"ר, ומשם המשיך למכבי פ"ת, בה שהה במשך ארבע עונות.
בשנת 1989 חצה את הכביש פעם נוספת, והגיע להפועל פ"ת. בעונתו הראשונה, בקבוצה, 1989/90, כבש רפי כהן ארבעה שערים והפועל סיימה במקום השני. עונה לאחר מכן שיחק בעיקר כמחליף, אך גם כך הוסיף חמישה שערים נוספים. שניים מהם בתוספת הזמן של המחזור האחרון, במשחק בו הושג ניצחון 1:2 על מכבי ת"א, מה שלא הספיק בשביל להדביק את מכבי חיפה שזכתה באליפות עם נקודה אחת יותר.
העונה האחרונה שלו במדי הקבוצה היתה עונת 1993/94, בה רשם שבע הופעות. לאחר מכן פרש ומונה לעוזרו של גיא לוי בבוגרים (עונת 1995/96) ובעונה הבאה החל לאמן במחלקת הנוער של המועדון, במשך שנתיים.
בהמשך שב להיות עוזר מאמן בבוגרים, ושימש כעוזר תחת גיורא שפיגל (1998/99) וניר לוין (1999/2000), ואז עזב להפועל חיפה, שם שוב שימש כעוזר מאמן תחת גיא לוי. בשלב זה עבר לתפקד כמאמן ראשי, ובית"ר/שמשון ת"א היתה קבוצתו הראשונה.
לאחר מכן אימן בהכח ר"ג ועלה איתה מהליגה השלישית, ומשם המשיך לאשקלון ושיחזר את ההישג, כשבדרך הוא גם מוביל אותה לחצי גמר גביע המדינה. בעקבות הצלחותיו בעונה זו הוחלט למנות אותו למאמן הראשי של הפועל בתחילת עונת 2005/06.
הקבוצה עברה זעזוע חריף לפני עונה זו, הסגל שעמד לרשותו היה בעייתי, והתוצאות היו בהתאם - חמש נקודות בלבד בשמונה מחזורים (כולל ארבעה הפסדים רצופים במחזורים 5-8), ומקום לפני אחרון.
בעקבות פתיחה כושלת זו הוחלט לפטרו, וניר לוין מונה לתפקיד במקומו.
קישורים:
ויקיפדיה (נפתח בכרטיסייה חדשה) - רפי כהן
![1989/90 - מחזור 11 - בני יהודה (1:1) - מתוך [anew href="http://www.bnei-yehoda.co.il"]האתר הרשמי [/anew] של בני יהודה.](https://images.hpt.co.il/images/1990_11_BY1-1_pic1.jpg)
