יובל קפיטולניק החל את דרכו בהפועל פתח תקוה בעונת 1982/83, בגיל 18. הקבוצה שיחקה אז בליגה השנייה תחת הדרכתו של אביו, אהרון קפיטולניק, והוא שותף בשלושה משחקים בעונה זו והבקיע שער אחד.
בעונת 1983/84 המשיך בקבוצה, שנפרדה בינתיים מאביו, וסייע לקבוצה להעפיל לליגה הראשונה עם ארבעה שערים ב-17 הופעות ליגה.
בעונת 1984/85 עבר להפועל לוד, אותה אימן אביו, ולאחר שזה עזב את הקבוצה עבר לקרית אונו וכעבור שני מחזורים המשיך לשמשון תל אביב. באמצע העונה הבאה שוב עבר לקבוצה אותה אימן אביו, הפעם רמת עמידר מהליגה השנייה.
בעונת 1986/87 חזר קפיטולניק לשמשון תל אביב, ובאמצע עונת 1987/88 עבר להכח רמת גן. באמצע עונת 1988/89 חזר לקדנציה שנייה בהפועל פתח תקוה, אך שיחק בארבעה משחקים בלבד, שניים מהם בגביע הטוטו.
בעונת 1989/90 שיחק במכבי חדרה, ולאחר מכן פרש מכדורגל בגיל 25 בעקבות פציעות חוזרות ונשנות מהן סבל. לאחר הפרישה עבר לעסוק בתחום אימוני כושר והקים את חברת "דינמיקל שירותי כושר".
